微生物洁净室设置净化空调系统是为了建立一个温、湿度适宜、空气清新、无菌洁净的微环境，以利于实验操作。传统的空调系统仅能对温度起到一定的控制，洁净度无法完全得到控制，因而导致病菌的滋生和繁衍。这样的空调系统远远不能满足微生物实验室一个特定的洁净环境的卫生学要求。
净化空调系统通过一系列的技术措施精心设计后完全能够做到控制实验室内温度、尘埃、细菌、有害气体的浓度和气流分布、保证室内人员所需新风量和室内合理的气流流向，并能维持整个微生物实验室合适的梯度压力及定向流动，全面实现“无菌环境保障体系”的目的，减少实验过程中一切潜在的感染风险。结构设计上还有一个突出特色是室内大多数空调设备的维修保养均在室外进行，减少非实验人员进入实验室的机会，减少污染，提高实验室的使用率。
1、净化空调系统划分
每个洁净实验室为独立的空调系统,并且缓冲间和净化实验室都是分开的独立空调,防止实验时的内部交叉感染和防止危险气体向外泄漏。
2、空气处理净化过程
室内回风由中效过滤器回风口(回风口采用获得国家专利的定风向可调风量回风口，可以在实验室内很方便的拆卸更换滤料)。通过回风管回到净化组合式空气处理机的回风段，经冷却或加热，再经过机组内的初、中效过滤器（过滤器置于机组正压段）由送风管送至配有高效过滤器的送风末端后送出。室外新风经过虑处理后进入净化组合式空调机组的新风混合段与室内回风混合。再经卫生型净化组合式空气处理机进行温湿度处理后统一送入洁净区。
3、送风方式及气流组织形式
实验室末端送风采用专用484送风静压箱。送风静压箱内满布进口高效低阻无隔板高效过滤器，底部装有送风扩散孔板（扩散孔板与实验室天花板相接处平整无缝）；局部百级实验室配有层流罩采用垂直层流的气流组织形式,其外形尺寸为1240X635,内部满布高效过虑器,底部装有均流扩散孔板.洁净室内回风为四角底部回风保证了室内气流的充分流动,带来很好的稀释效果.缓冲间采用高效送风口上送下回风乱流气流组织形式.为墙面单侧底部回风。
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